乳制品是富營養化物質，加工過程很容易受微生物污染，因此選擇合適的消毒劑很重要。二氧化氯不僅殺菌消毒作用強于其它類消毒劑，而且不會破壞乳制品的營養成分，對人、動物無害。目前發達國家已將二氧化氯應用到幾乎所有需要殺菌消毒的食品加工領域。
二氧化氯可以適用于牛奶、羊奶、馬奶等液體乳類、還原奶（乳）、奶粉（乳粉）奶片、煉乳、乳脂肪、奶酪、干酪、乳冰激凌和干酪素、乳糖、乳清粉、濃縮乳清蛋白等其他乳制品類的加工制造過程的殺菌、消毒、保鮮。
【二氧化氯消毒劑在乳制品加工中的消毒方法】
1、調奶用水、生產用水的消毒：按照國家飲用水標準，投入二氧化氯消毒液投加濃度為0.5-1mg/L。
2、運輸工具、進廠大門、進入車間處鞋靴池等的消毒：用100-200mg/L的二氧化氯消毒液浸泡、噴灑。
3、車間和冷庫內部環境消毒：以1000mg/L二氧化氯消毒液熏蒸空氣或100-200 mg/L的二氧化氯消毒液噴灑或擦拖。
4、管道、罐體等帶CIP系統的消毒：以50-100mg/L的二氧化氯消毒液泵循環消毒15分鐘以上或浸泡8小時過夜。
5、灌裝機、灌裝頭、傳送帶等設備表面的消毒：用100mg/L的二氧化氯消毒液擦拭。
6、工作人員手、鞋靴、衣物、工具等物品消毒：清洗后，用30–100mg/L的二氧化氯消毒液浸泡。
【以下幾個型號的二氧化氯適合在乳制品生產加工中使用】
1、 高純二氧化氯消毒劑
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2、 穩定性二氧化氯溶液
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3、一元二氧化氯消毒粉
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